新建的排污企業在驗收后都是要向環保部門申請排污許可證。申請需要提交相關的材料，初次辦理排污許可證的新建項目和二次辦理排污許可證的企業所需要提交的申請材料是不一樣的。若是申請材料不齊全，在申請上交后當場或五日內環保部門將一次告知申請人需要補正的全部內容。
排污單位初次申領排污許可證，應當提交下列證明申請材料：
①排污單位出具的申請說明文件（一個月內有效）和排放污染物許可證的申請表；
②營業執照、組織機構代碼證、法人代表和經辦人等法定身份證明；
③主要污染物排放總量指標的批復意見；
④建設項目環境影響評價文件及批復意見；
⑤建設項目竣工環境保護驗收批復文件；
⑥近一年的污染物排放監測報告；
⑦竣工驗收中所需整改項目的落實情況和其他相關的證明材料。
排污企業在填報資料的同時，需要到市環保局網站上登錄進行網上申報，排污申請表、環評文件和監測報告需要提交電子版，其他的提供掃描復印件即可。若是企業不懂該如何進行申請和準備申請材料，最好是委托專業的環保公司進行處理，既能夠保證提交材料的全面性，明白自己應該做些什么，還能比企業自己區申報節省很多時間，在更短的時間內拿到排污許可證。